Логотип разработан на основе заглавной буквы L (от слова Латвия) в сочетании с изображением листьев, которые символизирют латвийскую природу.
Буква L состоит из трёх частей и трёх цветов, которые символизируют три основные функции музея:
- холодный зелёный – сохранение унаследованных фондов музея и создание коллекций для будущих поколений;
- тёплый зелёный – исследование фондов;
- фиолетовый – экологическое образование общества.
Логотип разработала ведущий дизайнер дизайнерского бюро BUMBIERKOKS Анитра Эглите-Пойкане.