Геологическое собрание насчитывает более 43 000 единиц. Минералы, породы и окаменелости собирались со времени основания музея и пополняются в настоящее время. Обширна и разнообразна коллекция осадочных пород Латвии. Неповторимы коллекции пород Закавказья и Кольского полуострова, собирать которые помогали участники геологического кружка. Продолжает пополняться коллекция балтийского янтаря.
При финансовой поддержке Государственного Фонда культурного капитала и Фонда Кохезии в геологическое собрание поступили голубой сапфир, золото, алмаз, красноватая шпинель, лидикоатит, внушительные жеоды аметиста и цитрина, друза горного хрусталя, синий и зелёный доминиканский янтарь и др.
Наиболее ценные дары последнего времени – гипсы (роза пустыни), медь и пиротин.
